MAP是多重抗原多肽，是将线型多肽的C端连接在多聚Lys核心上形成的分枝多肽，从而增大了整个分子的大小。虽然MAP减少了多肽与KLH交联的步骤，然而由于MAP多肽的构象活动空间有限，通过它产生的抗体与通过KLH交联法产生的抗体相比常常不能被蛋白识别。再者，做MAP时没有自由的肽产生，因而很难除去对多聚Lys核心部分产生的抗体。HPLC纯化MAP很困难。而且由于MAP分子的不均一性和很大的分子大小，也不能提供质谱鉴定。