无菌层流病房广泛用于血液科的白血病病房、烧伤科病房及烈性传染性病房。现在很多医院无菌病房都设计成垂直层流形式，而实际上水平层流形式也是一种很好的选择，层流病房造价较高，运行费用更高。为此也可以设计成1000级净化小室，这样造价低，净化效果也较好。