微波干燥设备中的微波变压器是为磁控管提供工作高压的主要器件，保证微波干燥设备的正常工作。微波变压器是把220V输入电压利用电磁感应原理将输出电压转为2150v,主要由初级线圈，次极线圈，灯丝线圈，绝缘材料等组成。2450赫兹的小功率连续磁控管的工业微波设备配套的就是小型漏磁变压器，它的输出功率是900瓦到1000瓦。当它连续工作至温度130度以上，它的输出功率就会降低，主要有风冷散热与油浸水冷散热两种。
   风冷散热系统就是利用如风扇或其它风对变压器进行散热，但如果散热不畅通则会导致线圈温度升高、绝缘层会熔毁或高压击空，而长期在粉尘较大的空间工作，变压器吸附到粉尘也会使它的散热能力下降，电气的击穿强度导致击穿损坏。
    油浸水冷散热系统就是使用变压器油改变工作产生的热量，将微波变压器浸到变压器油当中，再采用冷却水在套管中的循环冷却使变压器的温度控制在100度以下，这种方式可以避免变压器受空气环境的影响，但必须满足水冷的冷却量要充足，进水温度常年保持35度以下，变压器油也需经常更换与过滤。