Tosoh公司提供三种不同的疏水反应色谱柱（TSKgelPhenyl-5PW，Ether-5PW，Butyl-NPR），疏水反应、反相色谱、盐析的所有分离原理都以蛋白质疏水性为基础。盐析是一个蛋白质分子的疏水部分结合另一个蛋白质分子的疏水部分的随意过程。而疏水反应色谱和反相色谱中，与另一个蛋白质分子相结合相比，蛋白质分子更有可能结合在固定相的相对的疏水性表面。因此，此两种色谱柱都允许蛋白质的选择性结合和脱附的进行。HIC与RPLC相比，表面吸附强度要低得多，因此不会扰乱蛋白质分子的结构。而在RPLC中，常用的有机溶剂能促进蛋白质分子的变性。可以说，HIC是温和的技术，对一系列蛋白质具有优良的活性再现性。