Illumina公司发布了HiScanSQ新平台，它是第一个既能开展芯片实验，又能进行DNA测序的产品。芯片和测序这两项热门的技术催生了性状和疾病研究方面大量开创性的发现。HiScanSQ整合了基因分型、基因表达和甲基化阵列的高通量性能，以及新一代测序的力量和分辨率，为实验设计带来了前所未有的灵活性。 仪器特有两个不同的组件：HiScanReader 一台高性能的扫描仪（上图左），以及SQModule 一个附加的流体学设备（右），能够实现基因组规模的测序。HiScanReader作为一台适用于IlluminaBeadArray产品的高速精确的芯片扫描仪，独立地发挥作用。有了SQModule，系统迅速地转换到执行Illumina的边合成边测序技术，即世界上最广泛采用的新一代测序技术。HiScanReader有着两种激光，波长分别为532nm和660nm。其时间延迟积分（TDI）扫描和两个CCD传感器具有高分辨率的性能和快速率。而HiScanSQ作为一台测序仪，目前每一轮能产生多达50GB的高质量数据，每天最少能产生6GB的高质量过滤数据。每个流动槽通道能运行1-12个样品，这样每个流动槽能运行8-96个样品。