堆肥发酵菌种是一种复合菌种能快速分解有机质，具有添加量少、强力降解蛋白质、发酵时间短、成本低、发酵温度不受限等优点，堆肥发酵菌种能有效杀死发酵物中的有害菌、虫、虫卵、草籽并降解抗生素残留等。繁殖快速、生命力强、安全无毒等特点。
堆肥发酵菌种含有高浓度的非致病性有益微生物，并添加了能够分解各种大分子物质的多种酶。该产品中的微生物能够在堆肥过程中产生消化酶来分解发酵堆肥中的有机质。在堆肥过程中添加本浓缩产品以补充原始菌种，并加强对有机质的分解以便利用城市垃圾、废水污泥、固体废物生产腐殖质堆肥。
污泥堆肥作用机理：
好氧条件下，堆肥物料中的可溶性有机物透过微生物的细胞壁和细胞膜被微生物吸收；固体和胶体有机物质先附着在微生物体外，由微生物分泌胞外酶将其分解为可溶性物质，再渗入细胞。微生物通过自身代谢活动，使一部分有机物被氧化成简单的无机物，并释放能量，使另一部分有机物用于合成微生物自身细胞物质和提供微生物各种生理活动所需的能量，使机体能进行正常的生长与繁殖，保持生命的连续性。
堆肥中的微生物在分解过程中产生大量的热来给堆肥加热。这种高温对快速分解是必需的，而且有利于破坏杂草的草种、昆虫的幼虫、有害细菌等，并能抑制某些疾病的滋生，避免这些疾病产生有害微生物阻碍植物的正常生长。
发酵微生物菌群的添加能够提高分解速度与效率，因为这些菌群是经过筛选、驯化、培养并改良的高浓缩细菌与真菌混合物。这些菌种被选来更好的生存与繁殖、同时产生酶，分解有机废物，从而在堆肥生成过程中加速有机质的分解。
分解木质纤维素菌体的标准概念是先打开纤维结构使糖可用于不同微生物的新陈代谢。微生物利用纤维素酶、木聚糖酶、淀粉酶、蛋白酶、分解木质素的酶等从纤维素、半纤维素、蛋白质、淀粉和其他碳水化合物中向堆肥释放糖分。目标菌在堆肥中的生长加强了，就能有效抑制杂菌生长，从而防止产生臭味和致病菌等有害物质。